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Synchronous L1 retrotransposition events promote chromosomal crossover early in human tumorigenesis

Fecha de publicación: Agosto 2024 DOI: 10.1101/2024.08.27.596794

Este estudio me permitió comprender cómo los eventos de retrotransposición LINE-1 pueden inducir reorganización cromosómica en los primeros estadios del cáncer. Lo aprendí a través del análisis de datos genómicos y la interpretación de sus implicaciones en la estabilidad del genoma. Me ha servido para profundizar en la relación entre elementos móviles y oncogénesis, y en el futuro, podría aplicar este conocimiento en la identificación de nuevas dianas terapéuticas.

Unravelling epigenetic mechanisms in Cerastoderma edule genome: a comparison of healthy and neoplastic cockles

Fecha de publicación: Mayo 2024 DOI: 10.1007/s00438-024-02148-z

Gracias a este trabajo, adquirí experiencia en la identificación de modificaciones genéticas y epigenéticas asociadas a enfermedades en organismos marinos. Esto lo aprendí mediante el uso de técnicas bioinformáticas para el análisis genómico y de metilación del ADN, así como herramientas de comparación de genomas y epigenomas. Esta investigación me ha servido para entender la importancia de los modelos no humanos en biomedicina y, a futuro, tal vez podría contribuir a estudios sobre genómica y epigenómica comparada en otras especies.

Somatic evolution of marine transmissible leukaemias in the common cockle, Cerastoderma edule

Fecha de publicación: Julio 2023 DOI: 10.1038/s43018-023-00641-9

En este estudio, aprendí sobre la evolución somática de los cánceres transmisibles y su impacto en poblaciones naturales. Lo adquirí a través del análisis de datos genómicos y filogenéticos, así como el estudio de la evolución del cáncer en un contexto ecológico. Me ha servido para ampliar mi perspectiva sobre la biología del cáncer y, en el futuro, podría aplicar este conocimiento en estudios de oncología comparativa.

Aberrant integration of Hepatitis B virus DNA promotes major restructuring of human hepatocellular carcinoma genome architecture

Fecha de publicación: Noviembre 2021 DOI: 10.1038/s41467-021-26805-8

Este trabajo me permitió investigar cómo la integración del ADN del virus de la hepatitis B afecta la estabilidad genómica en el carcinoma hepatocelular. Aprendí a identificar eventos de inserción viral mediante análisis bioinformático y su impacto en la arquitectura del genoma. Me ha servido para comprender mejor la relación entre infecciones virales y cáncer, y en el futuro, podría aplicar estos conocimientos en el estudio de otros virus oncogénicos.

Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition

Fecha de publicación: Febrero 2020 DOI: 10.1038/s41588-019-0562-0

Gracias a este estudio, aprendí cómo los elementos móviles pueden promover reorganizaciones genómicas en distintos tipos de cáncer. Mediante el análisis de datos de secuenciación de genoma completo, adquirí habilidades en la identificación de firmas genómicas asociadas a retrotransposición. Me ha servido para reconocer la relevancia de los elementos transponibles en la evolución tumoral y, quizás se podría aplicar esta perspectiva en la búsqueda de biomarcadores genéticos.